I tillegg til mikroskoper og petriskåler , datamaskiner er et viktig verktøy for mikrobiologer . Programvare for mikrobiologi forskning omfatter verktøy som brukes av andre vitenskapelige og tekniske disipliner samt spesialiserte applikasjoner for studiet av bakterier og andre mikroorganismer . Mange programmer som er utviklet av offentlige organer , non-profit stiftelser eller akademiske forskere er tilgjengelig som gratis programvare for å laste ned og bruke som eksperiment eller lab krever. Visualiseringsverktøy
En fysisk eller mentalt bilde av rådata du samler kan hjelpe deg bedre forstå sin kvalitet, betydning og konsekvenser . Åpen kildekode og kommersielle data visualisering programvare er allment tilgjengelig for mikrobiologi forskning. Lage diagrammer og grafer over dine data ved hjelp av LibreOffice Calc , Microsofts Excel eller Mondrian data - visualisering system . Cell- O og RasMol applikasjoner hjelpe deg å lage 2D-og 3D -animerte modeller av biologisk viktige molekyler som proteiner og aminosyrer .
Matematisk modellering
Store samlinger av mikrobiologi data ofte gir mer meningsfull informasjon når de har blitt tallmessig analysert . MATLAB , Octave og SciPy programvarepakker som utfører matematiske raffinement, analyse og modellering av forskernes data . Bruk disse pakkene til å gjøre parameter estimering gjennom kurvetilpasning , epidemiologiske spådommer , bakterievekst simuleringer og data støy eller stokastisk effekt eliminering. Disse søknaden også utføre statistiske beregninger , som variansanalyse eller khikvadrattester .
Genome bioinformatikk
Mikrobiologi programmer også hjelpe deg med å visualisere og utvinne informasjon fra sekvensen av nukleinsyrer som utgjør en mikro- organismens DNA. The Open bioinformatikk Foundation gir gratis, open -source DNA-sekvensering og analyse applikasjoner som BioJava og Biopython som trekker ut data fra genom informasjon banker , analysere en organismes DNA-koden og sammenligne den med andre DNA-prøver . Andre genom analyse pakkene inkluderer Relieff, HMMER , Clustal Omega , Fylogeni Inference Package, eller PHYLIP , og sekvensen Manipulasjon Suite eller SMS .
Reference Programvare
Den raske tempoet i vitenskapelige funn i mikrobiologi og endrede statlige reguleringer gjør det viktig at mikrobiologer har tilgang til informasjon som påvirker deres arbeid. HUGO er en kommersiell programvarepakke som gir mikrobiologer med oppdatert informasjon om verktøy , kjemikalier , utstyr, vekstmedium , sikkerhetskrav , nye organismer, taksonomiske endringer og antibiotika . I tillegg kan mikrobiologer arbeider i matvitenskap bruke ComBase Browser Web applikasjonen tilgang til mat-relaterte mikrobiologiske data fra offentlige etater i Storbritannia , Australia og USA .
