Her er to ulemper med integrerte programvarepakker:

1. Begrenset funksjonalitet: Mens de tilbyr et bredt spekter av verktøy, mangler integrerte pakker ofte dybden og spesialiserte funksjoner som finnes i frittstående applikasjoner. Dette kan være en ulempe for fagpersoner som krever avansert funksjonalitet på bestemte områder, som regnskap, grafisk design eller dataanalyse.

2. Læringskurve: Integrerte pakker har vanligvis en brattere læringskurve på grunn av kompleksiteten i å mestre flere applikasjoner i et enkelt grensesnitt. Brukere kan trenge å investere mer tid i trening og bli kjent med forskjellige funksjoner og arbeidsflyter, noe som kan hindre produktiviteten til å begynne med.